El eje Agroecología del Champal tiene como principal objetivo de acompañar al desarrollo de una agricultura sostenible que respeta la Pachamama, el agua, el aire, los ecosistemas y provee una alimentación saludable a la población.

La agroecología es un sistema de agricultura que respeta la biodiversidad y la utiliza como fuerza para ser más productiva, favorecer el desarrollo de los ecosistemas, el equilibrio entre las especies.

La agroecología se caracteriza por fusionar los valores científicos con los valores sociales. Analiza el sistema agrario desde un punto de vista integral incluyendo aspectos ecológicos, económicos y socioculturales dentro de cada localidad donde se desarrolla, para plantear soluciones a los problemas y fortalecer la capacidad productiva a través del intercambio de conocimientos empíricos entre los miembros de la comunidad y demás actores involucrados en el proceso agricultor y las últimas tecnologías en el área.

Promovemos también la permacultura que es un sistema de principios de diseño agrícola y social centrado en la simulación o directamente en el uso de los patrones y las características observadas en los ecosistemas naturales.